Perbedaan antara biodiesel dan biofuel adalah bahwa biofuel merupakan salah satu bahan bakar sedangkan biodiesel adalah salah satu bentuk biofuel. Biofuel adalah bahan bakar yang dibuat dari komponen selain produk minyak bumi, seperti alkohol, metanol, kedelai, dan lain sebagainya. Biodiesel sendiri terbuat dari minyak nabati. Kategori ini berisi banyak bahan bakar yang berbeda, dari kayu-bakar untuk limbah manusia dan hewan dan asap TPA.
Dengan biaya bahan bakar berbasis minyak bumi yang terus naik dan kesadaran kolektif dunia yang condong ke arah sebuah cara hidup hijau,maka semakin banyak orang berbicara tentang biodiesel dan biofuel. Masih banyak kesimpangsiuran atau kesalahpahaman di sekitar istilah-istilah ini. Biodiesel adalah sebuah konsep yang relatif baru,sedangkan biofuel telah digunakan oleh manusia sejak manusia gua mulai belajar untuk memasak makanan dan memanaskan gua mereka dengan perapian terbuka. Biofuel dapat diidentifikasi sebagai yang terbaik dari jenis bahan bakar yang dibuat dari materi biologis yang membusuk, seperti kayu atau sampah, atau lemak binatang dan sayuran.
Biodiesel dan biofuel dapat membantu beberapa negara untuk menurunkan ketergantungan pada minyak, sedangkan produk-produk seperti bensin E-85 bukan biofuel. Produk ini mengandung 15% minyak bumi dan juga berbasis etanol bahan bakar. Dalam hal ini, bahan bakar fosil secara teknis adalah biofuel karena mereka dibuat dari tanaman dan binatang yang mati selama jutaan tahun. Perbedaan utama adalah bahwa biofuel terbarukan, dimana bahan bakar fosil tidak sama sekali.
Pada umumnya, biofuel menghasilkan lebih banyak energi daripada energi yang diperlukan untuk membuat biofuel. Hal ini membuat biofuel sebagai sumber energi terbarukan yang dapat diproduksi sepenuhnya dalam satu negara dari tanaman dan hewan yang dibesarkan oleh petani setempat. Dari sudut pandang yang ekologis, biodiesel dan biofuel lainnya menghasilkan rata-rata 70% lebih sedikit emisi karbon dioksida ke atmosfer ketika dibakar dibandingkan dengan bahan bakar diesel.
